Сейчас вообще справка из ПФР об отсутствии задолженности не нужна налоговой. ИП ликвидируют сейчас и с долгами. Долг, если он есть, останется висеть на физ. лице. Можно и после получения св-ва о прекращении деятельности ИП обратиться в ПФР, чтобы погасить имеющуюся задолженность